Зав. отделением 
Шибаев Михаил Игоревич
кандидат медицинских наук
квалификационная категория высшая
 Старшая мед.сестра
Колина Наталья Алексеевна
квалификационная категория высшая
Врачи отделения:
- Маслов Вячеслав Васильевич, врач-эндоскопист, Заслуженный врач Республики Карелия
 - Мельникова Нелли Викторовна, врач-эндоскопист
 - Мячина Екатерина Николаевна, врач-эндоскопист
 - Чудинов Алексей Александрович, врач-эндоскопист, Заслуженный врач Республики Карелия
 
В отделении внедрен весь перечень эндоскопических манипуляций и операций: ФГДС с диагностической и лечебной целью, колоноскопии, бронхоскопии, ретроградные холангиографии, эндоскопические папиллотомии, ректоскопии. Освоены эндоскопические операции на верхних и нижних отделах ЖКТ, трахее и голосовых связках, большом дуоденальном соске. За время существования отделения подготовлено более 25 эндоскопистов для районов Карелии и города Петрозаводска. Отделение стало ведущим эндоскопическим отделением Карелии. За год выполняется более 7 тысяч исследований и около 200 операций. 
В эндоскопическом отделении проводятся:
- Исследование верхних отделов ЖКТ (пищевод, желудок 12-перстная кишка), а также исследование толстой кишки с взятием материала на гистологическое и цитологическое исследование
 - Исследование бронхиального дерева (ФБС)
 - Рентгеноконтрастное исследование желчевыводящих путей (ЭРХПГ)
 - Селективная бронхография под контролем ЭОПА
 - Лечение через эндоскоп язвенной болезни желудка и 12-перстной кишки инъекционным методом
 - Удаление полипов и доброкачественных опухолей из верхних отделов ЖКТ и толстой кишки
 - Лечение рефлюксоэзофагита
 - Рассечение рубцовых сужений анастомозов
 - Удаление инородных тел из пищевода, желудка, 12-перстной кишки и бронхиального дерева
 - Остановка гастродуоденальных кровотечений
 - Склерозирование варикозных вен пищевода
 - Эндоскопическая папиллосфинктеротомия и удаление камней из желчных протоков
 - Проведение зондов для питания
 - Санационные бронхоскопии
 
